腳趾長肉裏，要根據具體症狀採取處理。症狀較輕時可以用活力碘紗布局部濕敷，如果感染較重，則需應用抗生素治療，反覆感染或化膿者，需進行手術治療。
腳趾長肉裏，但沒有明顯的疼痛感，或者僅有局部輕微疼痛，建議使用0.5%活力碘紗布局部濕敷，能起到消毒殺菌的作用，可以減輕局部炎症，疼痛症狀也隨之緩解。之後要注意觀察，儘量寬鬆舒適的鞋子，減少對患處的摩擦。
如果炎症反應較為明顯，通過上述方法處理之後並不能改善，可以考慮外用抗生素類藥膏，常用的有紅黴素軟膏、金黴素軟膏以及莫匹羅星軟膏等。必要時可配合口服抗生素，如頭孢拉定膠囊、頭孢克肟膠囊、阿莫西林膠囊等。
如果患者腳趾甲完全嵌入肉內，造成反覆感染以及局部化膿的現象，上述方法治療效果欠佳，需要行手術治療。通常是選擇拔甲術，將腳趾甲拔除，並對甲牀進行整形處理，避免新生的腳趾甲再次嵌入肉內。
