有很多疾病可引起男性不育，附睪炎是其中一種，引起不育的原因如下：
降低精子的活力
附睪受到感染後，病原體可直接對附睪管中的精子造成損害，抑制精子的活動度或使精子發生凝集，以降低其活動能力;病原體吸附在精子表面，使其活動力降低甚至喪失;病原體產生的毒素也會毒殺生性脆弱的精子，使其死亡率大大增加，導致男性不育。
堵截精子的行走通道
淋球菌、結核桿菌、支原體、衣原體等病原體感染引起的附睪炎，不僅會發生炎症反應而損害精子，而且易引起附睪管腔的縮小或堵塞，導致附睪尾部與輸精管連線處不完全性或完全性梗阻，最終引起不育。
困住精子
附睪炎是導致男子體內形成抗精子抗體的重要原因。附睪發生炎症時，身體的自衛系統就會立即行動，白細胞、淋巴細胞等免疫細胞和體液免疫物質進入發炎的附睪管內，對病原體產生清除反應，形成免疫反應，產生免疫細胞，同時免疫細胞對機體自身組織的識別能力明顯下降，直接與精子表面或精漿中的抗原物質發生免疫反應，形成抗精子抗體，導致男性不育。
