白塞氏病的藥物治療，包括糖皮質激素、免疫抑制劑、非甾體抗炎藥及中藥等。
1.非甾體抗炎藥：主要用於治療發熱、關節炎、結節紅斑，如布洛芬、消炎痛、阿司匹林等。
2.糖皮質激素：其適應症為嚴重的眼部病變、高熱、大動脈炎、嚴重口腔及外陰潰瘍、伴有中樞神經病變急性發作、關節症狀;其使用方法為潑尼鬆30~60mg/d，病情控制後減量，其維持量為10mg/d。
3.免疫抑制劑：此藥物在糖皮質激素治療效果不顯著或治療重症白塞氏病時可加用，如嚴重中樞神經病變時;常見的藥物有①秋水仙鹼，對有關節病變及結節性紅斑者可能有效，有時對口腔潰瘍者也有一定療效;②環磷醯胺或甲氨蝶呤，靜脈靜注;③本丁酸氮芥，50~100mg/d口服，病情緩解後遞減至2~4mg/d維持;④環孢菌素A和α-干擾素。
4.抗凝劑：用於合併血栓病變，如鏈激酶、尿激酶、阿司匹林及潘生丁等。
5.中藥：中醫認為白塞氏病是由於肝腎陰虛、溼毒薰發所致。選用甘草瀉心湯(炙甘草、半夏、乾薑、黃連、黃芩、大棗)，龍膽瀉肝湯(龍甘草、梔子、黃芩、木通、車前子、當歸、柴胡、甘草)及封髓丹(黨蔘、甘草、大棗、白朮)等加減治療。
