慢性結腸炎的中醫認證治療分爲4種，具體如下:
1、肝氣侮辱脾型:腹瀉和情緒變化後發生，胸部恐嚇膨脹疼痛，腹痛腹瀉，腹瀉疼痛減少，大便不暢，苔白，脈弦細。方用逍遙散合痛瀉必須減少。白芍、灼甘草在緩急止瀉的同時，加入檳榔、焦三仙施。
2、脾虛夾溼型:以神疲勞、無力、無力、腸鳴腹瀉、糞便夾有不消化物爲特徵，舌淡苔白、脈溼。方用參苓白朮散或香砂六君子湯加減。寒冷加肉桂、炮姜偏熱加黃連、黃芩苷和炮姜寒冷並用。
3、脾腎兩虛型：是本病的嚴重和難治階段，病程較長，以畏寒、面色晄白、腰膝酸冷、腸鳴腹瀉多在黎明前，或滑瀉、瀉下完谷不化之物爲特徵，舌淡苔白滑、脈沉細無力。方用四神丸合連理湯加減。把乾薑改成炮姜，加入烏梅、稠、烏藥等溫澀的腸道。
4、溼熱下注型:本病初期和發作時，以發熱、腹痛、內急後重、腹瀉紅白粘結或膿血爲特徵，舌紅苔黃膩，脈滑數。方用白頭翁湯和芍藥湯加減。熱加金銀花、紅藤溼加厚朴素、蒼朮。
