白塞氏病病程較長，並且又伴有口腔，眼部，及生殖器上的症狀，因些，一些患者一旦得了這個疾病，就成天感覺自己將面臨死亡，其實不然，除少數因嚴重內臟或神經損害而死亡外，多數病人在屢次復發後可自然痊癒。
但不管病情輕重，首先還要正確診斷是否患上此病，然後及早及時治療，這樣治好的機率相當大。 白塞氏病一般隨着病情發展呈良性預後。 但是, 中樞神經系統和大血管受累除外。有報道白塞氏病死亡率爲9.8％ ， 主要由於大血管病變、神經系統受累、以及潰瘍性腸穿孔。年輕病人死亡率更高(。白塞氏病人易於在吻合口和創傷部位形成複發性假性動脈瘤，也是白塞氏病致殘和致死的主要原因之一。
動脈損害經常出現在年輕病人疾病發展的晚期。動脈瘤的出現常常預後不良，特別是肺動脈瘤的出現。 總的看來，BD 出現血管病變預後不良。有報道白塞氏病動脈瘤的病人破裂機率約60％ 。
