肛周疼痛的症狀主要表現是肛門的內部以及肛門直腸周圍疼痛爲主的一種症狀，爲多種肛門直腸疾病所共有。而其疼痛的性質、程度以及伴隨症狀各有所異。輕視肛周疼痛的治療也會延誤導致肛周疼痛的疾病的治療，造成嚴重的後果。
（1）肛裂
引起的疼痛，呈週期性，多發於大便時或大便後，主要由糞便刺激，潰瘍裂口擴張所致。其疼痛爲陣發性灼痛或刀割樣疼痛，可持續數分鐘；待糞便通過後，疼痛減輕。另外，由於排便的刺激，內括約肌可呈持續性痙攣，引起潰瘍裂口劇烈而持久的疼痛；往往可持續數小時之久，患者坐臥不安，十分痛苦；嚴重者可疼痛24小時以上。除了疼痛，肛裂者常伴有出血、便祕等症狀。
（2）肛竇炎
一般爲肛門部微痛、墜脹，排便時因糞便壓迫發炎的肛竇而致肛門部灼痛，若括約肌因受刺激而攣縮，疼痛則加劇，並向臀部及股後部放射。常伴有少量膿性或粘液性分泌物外溢、氣味臭，日久可致肛周潮溼、瘙癢等不適。
（3）血栓性外痔
輕者有異物感，大多伴有脹痛。由於肛周靜脈血管破損，血塊凝結而成血栓，在肛門外皮下出現青紫圓形硬結節，一般在截石位3點、9點處。
