骶管囊腫可能是先天因素引起的，也可能是後天因素導致的。
1.先天因素：大多數患者的骶管囊腫是先天因素導致的，比如有先天性的硬膜憩室、先天性的硬膜缺陷，這時候都可能會導致腦脊液漏出，引起蛛網膜疝出，患者可能會出現骶管囊腫。
2.後天因素：在日常生活中如果患者發生了事故，腦部受到了外傷，腦脊液可能會填充到囊腔中，從而出現骶管囊腫。另外，勞累過度也會導致腦積液壓力增大，腦脊液外漏，時間長了一般會出現骶管囊腫。腦部的炎症導致蛛網膜出現感染時，腦積液會隨着動脈的搏動進入蛛網膜下腔中的囊腔中，最終也會形成骶管囊腫。
如果患者並沒有明顯的不適症狀，而且囊腫也不大，一般可以先暫時不處理，但是要注意定期觀察。發現囊腫迅速增大，或者患者有明顯的不適時，再選擇合適的治療方法積極治療，如微創手術，在顯微鏡下把囊腫壁切除。
