藥物流產過程會出現不同程度的疼痛，主要是服用藥物致使子宮收縮及個人耐受程度而定。
1、子宮收縮
藥物流產主要以聯合應用爲主，口服藥物主要刺激子宮蛻膜發生變性、壞死，同時促使子宮處於異常興奮狀態、收縮明顯，加速胚胎組織排出體外。子宮存在不同程度的收縮力，所以會感到下腹疼痛。
2、個人耐受程度
個人體質不同，藥物耐受也有一定的差異。耐受程度較弱者，服藥後會感到腹部疼痛明顯，耐受程度較強者，能夠承受子宮異常收縮，疼痛感比較弱。
