再次障礙可能發生在懷孕過程中，偶然合併或與懷孕有關。有些患者需要支持治療，有些患者在懷孕結束後會自行緩解。
再次患者懷孕後，懷孕期間的疾病有可能發展，特別是IST後，緩和者的復發風險很大。成功移植異基因骨髓的患者，懷孕不會增加復發風險。廊坊市中醫院血液科徐文江
最近對36名接受IST再障礙妊娠的研究發現，近半數孕婦與孕婦或胎兒併發症:5例早產、3例流產(其中1例爲自然流產)，但所有生育兒正常發育的2例孕婦發生子癇，2例孕婦產後死亡。19%復發，14%懷孕期間需要輸血。妊娠前血細胞計數正常，不能保證妊娠期再次發生障礙。與患者及其家屬討論孕婦和胎兒潛在的一系列風險是很重要的。告知相關風險後，患者最終決定是繼續懷孕還是終止懷孕。
由於預防措施比幾十年前有了很大的改善，很多重症患者可以安全度過孕期。單中心研究報告顯示，14名患者只支持治療，輸血維持血紅蛋白>80g/L，血小板>20×109/L，孕婦死亡1例。妊娠再障礙患者主要支持治療，輸注血小板可能維持患者血小板計數在20×109/L以上。
孕晚期重症再症患者使用ATG治療後，有1例報告稱，孕媽會產生正常健康的嬰兒，但在懷孕期間使用ATG是很危險的，所以一般不建議懷孕使用ATG。腎移植經驗表明，應用CsA是安全的，孕期患者可以考慮CsA治療。另外，一般人口的調查顯示CsA不會增加畸形風險。如果患者需要輸血或血細胞計數下降，則需要輸血支持，建議口服CsA治療5mg/kg/d維持血藥濃度在150-250μg/l之間。CsA起效很慢，一般在6-12周。
最後，妊娠期間應該嚴密監測患者自身情況和血象情況，但到後期應該更加頻繁，評估患者疾病嚴重程度，必需和產科及全科醫生保持密切聯繫。由產科醫生決定結束妊娠的方式。
