五味子糖漿的副作用有反酸、胃灼燒、睏倦，也會存在過敏反應，適量服用五味子糖漿大多不會存在明顯副作用，如果長期過量服用，可能會引發不適症狀。
五味子糖漿屬於中成藥物，副作用相對較小，主要功能是益氣補腎、鎮靜安神，對於神經衰弱、頭暈、失眠等不適症狀可起到治療效果。五味子糖漿可起到促進肝糖原合成作用，能夠加強糖代謝，同時可增強肝細胞蛋白質合成。是藥三分毒，任何藥物如果長期服用都會產生副作用，如果身體存在發熱或屬於糖尿病患者，要謹慎使用。
建議在藥物使用時需根據中醫辯證指導服用，通過辯證方法能夠更好把控病人病情，在藥物使用時需要注意存在外感風熱感冒病人不能服用，可能會導致過敏。
在服用藥物期間需保持飲食清淡，避免食用生冷、辛辣、油膩食物，服用藥物時儘量在飯後服用，以免導致引發胃腸道不適反應。
