巧克力囊腫大多生長在女性的卵巢當中，當得了巧克力囊腫就代表卵巢出現一定的問題。大家都知道女性懷孕是和卵巢有很大的關係的，所以得了巧克力囊腫就一定會影響卵巢的正常功能，從而影響懷孕。針對於沒有生育過的女性來說這是非常嚴重的問題，所以在沒有生過孩子又有生育要求的人來說如果巧克力囊腫不治療就會容易不孕。
巧克力囊腫已經成爲現代女性的多發病，它在大齡未生育的女性中並不少見，有人甚至認爲它很可能成爲這個世紀最爲嚴重的婦女疾病之一。所以在出現以後就需要及時的治療，有人就想要知道巧克力囊腫不治會怎樣？
巧克力囊腫是婦科病中最複雜的病，是最不易治療的良性腫瘤。它到處粘連，四處流竄，治療之後又很容易復發，纏綿難愈。無論是保守手術還是藥物治療，效果均不理想，而根治手術又不適合想要生小孩的女性。據瞭解，巧克力囊腫已經成爲現代女性的多發病，它在大齡未生育的女性中並不少見，有人甚至認爲它很可能成爲這個世紀最爲嚴重的婦女疾病之一。
巧克力囊腫除了讓女性在每個經期痛苦萬分之外，引起的最大麻煩就是不孕。因爲它會傷害到體內的組織，如果在腸胃附近，就會造成腹瀉腸胃疼痛；如果是在卵巢，就會影響到卵巢、輸卵管功能，造成不孕。
對於病例症狀較輕、囊腫很小或病情已自動緩解的女性卵巢巧克力囊腫者，腫可以進行藥物保守治療，使其縮小至完全消失；另外，口服避孕藥對於預防巧克力囊腫的復發有一定效果。
當女性在診斷出卵巢內患有混合性包塊時，可根據具體病情進行一到兩個療程的保守治療，之後再做B超複查，假如包塊有縮小可不用手術治療，假如包塊沒有改變或者有長大，就就需要考慮手術治療了。在治療期間，一定要遵醫囑，才能更快的治好。
