慢性肝炎持續時間可長達數年，甚至數十年，慢性肝炎會對肝臟造成損害、對身體其他器官的損害、心理的傷害。
1.對肝臟的損害：急、慢性肝炎患者，各型急性病毒性肝炎患者大多在6個月內恢復，尤其是甲型和乙型肝炎。但如爲急性重症肝炎或急性重症肝炎，則病死率很高，可達60％-70％，即使恢復，也往往發展爲肝硬化。
2.對身體其他器官的損害：現已證實，急慢性肝炎病毒可侵犯其他器官，如乙肝病毒標誌亦可在腎，胰，骨髓，甲狀腺找到。因此病毒性急慢性肝炎還有一個危害性，即是肝外組織的併發症，如關節炎，腎小球炎，結節性多動脈炎等，較少見的有糖尿病、脂肪肝、再生障礙性貧血、多發性神經炎、胸膜炎、心肌炎、心包炎等，發生肝外併發症。
3.心理的傷害：慢性肝炎不僅對患者的身體甚至生命造成危害，而且對患者心理上的打擊也是十分沉重的。無論是急慢性肝炎患者還是病毒攜帶者，在生活、社交、求職、升學等方面都會受到嚴重影響，由此改變一生的命運。因此，無論是急慢性肝炎發病者還是病毒攜帶者，都應該積極、主動、徹底地治療，絕不能對急慢性肝炎掉以輕心，也不能認爲急慢性肝炎病毒終身攜帶而不會發生病變。
