舒筋丸和舒筋健腰丸的區別主要在於舒筋丸具有祛風除溼和舒筋活血的作用，舒筋健腰丸有補益肝腎、強筋健骨、祛風除溼、活絡止痛的作用，兩者的不同之處在於舒筋健腰丸具有補益肝腎的效果，其他基本上相同。
舒筋丸屬於中成藥，可以起到祛風除溼、舒筋活血，用來治療風寒溼痹的患者，當患者出現四肢麻木和筋骨疼痛以及步行艱難時，可在醫生的指導下使用舒筋丸進行改善，但是這種藥物孕婦不能口服，運動員也要慎用。
舒筋健腰丸也是中成藥，可以起到消腫止痛、活血化瘀、祛風溼和補肝益腎的作用，兩者最大的區別就是舒筋健腰丸可以補肝益腎，但是舒筋丸沒有，舒筋健腰丸可以用來改善，因腰椎間盤突出所造成的坐骨神經疼痛，還可以改善腰部放射性疼痛，能夠提高患者的生活質量。
舒筋丸和舒筋健腰丸對胃腸道均會產生刺激，如果患者有胃腸道的慢性疾病，比如潰瘍和出血的問題要禁止使用此藥。
