非淋菌性尿道炎傳染性較強。通過直接性接觸、間接接觸、母嬰垂直傳播等傳染途徑進行傳播。
1、直接性接觸
直接性接觸回非淋菌性尿道炎主要傳播途徑，佔到非淋菌性尿道炎發病率75%左右。夫妻雙方一人感染應禁止性生活，如有必要夫妻同治，以免交叉感染。
2、間接接觸
接觸被非淋菌性病原體污染毛巾、浴盆、浴巾、馬桶等生活用品，通過間接形式感染疾病，但是並不多見。
3、母嬰垂直傳播
孕期女性若患有非淋菌性尿道炎，炎症上行感染至宮腔內可通過羊水、胎盤血液循環，出現宮內感染或孕婦選擇順產分娩時，嬰兒通過產道而感染致病菌，導致新生兒發病。
