別看乙肝病毒的直徑才42納米大小(1納米爲百萬分之一毫米)，卻包含着“五臟六腑”，劃分出好幾個“區”(部位)：前S/S區、前C/C區、P區和X區，真是“病毒雖小，五臟俱全”呀!乙肝病毒的“五臟六腑”都有可能發生變異。它們變異的目的一是逃避免疫系統的攻擊;二是發生耐藥，對抗藥物的抑制作用。
前C區和C區(基本核心啓動子)是決定如何“編寫”e抗原“程序”的關鍵部位。當機體免疫系統奮力向病毒發出攻擊時，或在強有力的藥物抑制下，乙肝病毒就有可能“屈服”，e抗原受到抑制，血清中乙肝五項指標的“大三陽”就轉變成了“小三陽”。
但病毒有時並不“甘心”失敗，它們爲了想出逃避免疫系統的攻擊的，就改變的模樣，不去製造e抗原或少產生一點e抗原，使自己看起來還是“小三陽”的樣子，照樣能產生病毒基因——DNA，成爲一種變異病毒。這種變異病毒就是我們常說的前C區/C區啓動子變異(簡稱：前C區變異)，也是我國《慢性乙型肝炎防治指南》中所說的e抗原陰性慢性乙型肝炎。
這種e抗原陰性的慢性乙型肝炎患者血清HBV DNA沒有“大三陽”的感染者那麼高，轉氨酶也常常在低水平上波動，但它對肝臟的破壞力不減，常常導致肝硬化和肝細胞癌。因此需要使用抗病毒藥物治療。
前S/S區是決定乙肝表面抗原“程序”編寫的部位，它也想逃避免疫系統的攻擊，丟掉病毒最外層的前S蛋白或S蛋白，生產出沒穿“外衣”的變異病毒。這種乙肝病毒在感染者的血清內查不出乙肝表面抗原，但仍有小量病毒DNA複製，抗HBc陽性。這種情況就是我國《慢性乙型肝炎防治指南》中所說的隱匿性慢性乙型肝炎。但這種情況是極很少見的，大家不必過分擔心。
P區是乙肝病毒DNA聚合酶所在地，拉米夫定、替比夫定等口服的抗乙肝病毒藥物就是通過抑制P區的DNA聚合酶從而達到抑制乙肝病毒複製目的的。因此，長期使用這些藥物治療後，就會在P區藥物作用的部位發生變異，變異後的乙肝病毒就對藥物產生了抗藥性(耐藥)。
服用核苷(酸)類藥物治療的患者，如果經常漏服，或者中斷治療，更容易發生耐藥。耐藥後治療就更困難的。要想預防耐藥的發生，就要做到：治療不盲目，服藥不間斷，檢查經常做，醫囑要遵從。
