大多數乙肝小三陽感染者肝病再活動後HBV DNA的水平低於免疫耐受期和免疫清除期乙肝大三陽的感染者。因此，乙肝母嬰傳播的風險比乙肝大三陽的感染者小。
如果乙肝小三陽的孕媽媽在肝病活動後，肝功能正常或僅輕度異常且HBV DNA<106 IU/ml，可以不使用抗病毒藥物，在新生兒出生後給予常規乙肝疫苗+乙肝免疫球蛋白聯合免疫的方法實施母嬰阻斷即可。
但有時，乙肝小三陽感染者的HBV DNA也會升高到106 IU/ml以上。這時，其母嬰傳播的風險也隨即增加。對於乙肝小三陽感染的孕媽媽肝病再活動後，如果HBV DNA升高到106 IU/ml以上，即使肝功能正常或輕度異常，從乙肝母嬰阻斷方面考慮，也推薦在孕28周以後服用替諾福韋酯、替比夫定或拉米夫定，降低乙肝母嬰傳播的風險。孕期肝功能正常者可以考慮在產後1～3個月內停藥。
綜上所述，非活動期乙肝小三陽準媽媽在孕期發生肝病再活動後，如果ALT升高到正常值上限2倍以上，保肝藥物治療效果不好，無論在何孕期，都應該考慮選擇抗病毒藥物治療，產後繼續治療。
如果肝功能正常或僅輕度異常，但HBV DNA升高到106 IU/ml以上，應考慮在孕28周以後開始服用抗病毒藥物，產後可以停藥，停藥後應加強監測。
