胎兒主動脈弓分支變異是否嚴重，應根據具體情況來分析。單純的主動脈弓分支變異一般不嚴重，若合併其他心臟畸形，則可能比較嚴重。
胎兒主動脈弓分支變異可能是先天性心臟病造成的，考慮存在先天發育畸形。在正常情況下，主動脈弓應當位於左側，從左心室發出後向左側胸腔走，但有些胎兒的主動脈弓是從左心室發出後向右側胸腔走，也可能像脊柱一側或者後側、右後側走，這種情況屬於右位主動脈弓，是主動脈弓分支變異。如果只是單純的主動脈弓分支變異，可隨着胎兒的發育而逐漸恢復正常，有一小部分出生後還未恢復正常，可選擇合適的時機進行治療，一般不嚴重。
部分胎兒主動脈弓分支變異會合並其他心臟畸形，比如動脈導管未閉或室間隔缺損等。這種情況相對來說比較嚴重，胎兒出生後可能會發生呼吸困難、吞嚥困難或聲音嘶啞等症狀。
