1、前列腺炎、睾丸炎、睾丸炎、尿道炎等生殖道感染，嚴重者影響男性生育能力。
2、染色體異常，常見的有男假兩性畸形、Klinefelter綜合徵和XYY綜合徵、46XY/47XXY等染色體異常導致睾丸生精障礙。
3、精子結構異常和精漿異常，可影響精子運動、獲得能力和頂體反應等。
4、男性性功能障礙、勃起功能障礙、早泄、不射精和逆行射精可能導致男性不育。
5、輸精管道阻塞、先天性和後天性阻塞影響精子運輸不育。
6、內分泌疾病、下丘腦功能障礙、Kallmann綜合徵等，主要是促性腺激素釋放激素不足的垂體功能障礙，如選擇性黃體生成素(LH)缺陷症和尿促性素(FSH)缺陷症、高泌乳素血癥等。腎上腺皮質增生症可抑制垂體分泌FSH、LH，導致不育。
7、免疫性不育，男性自身產生的抗精子抗體和女性產生的抗精子抗體均可影響精子活力及對卵子的穿透力。
8、藥物因素:常見的有西米替丁、柳氮磺吡啶、雷公藤、螺內酯、呋喃西林、尼立達唑、秋水仙素、各種激素類藥物和癌症化學治療藥物，如烷基化合物，往往會造成暫時或永久對精子的損害。
9、睾丸生精功能異常，睾丸、睾丸、睾丸、病毒性睾丸炎、精索靜脈曲張、毒素、磁場、高熱、外傷等理化因素可引起睾丸生精障礙。
10、不良的生活習慣和工作因素。長期穿緊身褲、嗜煙、酗酒、接觸有毒物質、熱水浴頻繁、房事不當或頻繁、長途、過度勞累、騎自行車、放射線損傷等。
11、手術因素，如尿道瓣膜手術、尿道梗阻施行的膀胱頸切開術、腹膜後淋巴結清除術或較大腹膜後手術，均可引起逆行射精或射精障礙，導致不孕。
12、其他纖毛滯留綜合徵表現爲患者兒童時期患慢性呼吸道疾病，成年後精子尾部纖毛異常，精子向前遊動能力弱。
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