直腸息肉的分類按組織學表現和病理性質分類。
①新生物:包括管狀腺瘤、管狀絨毛腺瘤、絨毛腺瘤和家庭性腺瘤息肉病。這種息肉是腸上皮生長的新生物，容易發生癌變。
②錯構瘤:這種腫瘤是正常組織的異常混合，是一種或幾種組織過度生長的腫瘤。包括幼年息肉、幼年息肉病、黑斑息肉和黑斑息肉綜合徵。息肉一般不會惡變， 但息肉病則多會惡變。
③炎性息肉:即假息肉，由腸粘膜潰瘍引起。常見的是慢性潰瘍性結腸炎、良性淋巴息肉和良性淋巴息肉病，屬於正常淋巴組織，與癌變無關。
④增生性息肉:又稱化生性息肉。是直腸和結腸粘膜上的無蒂總結節，單獨孤立，多發，顏色與周圍粘膜相同，直徑只有幾毫米，一般無症狀，多發腺瘤。
⑤綜合徵類：該類病在腸胃內有息肉， 在胃腸道外有特殊表現。
