腸胃炎誘因可分爲感染因素和非感染因素，感染因素包括病毒、細菌和寄生蟲感染，非感染因素則包括消化液反流、長期食用不健康食物或藥物和腸道菌羣失調所致。
如輪狀病毒、諾如病毒、星狀病毒、腺病毒等，兒童主要以輪狀病毒、諾如病毒爲主，成人因諾如病毒感染誘發胃腸炎的概率，高於其他病原體。
2.細菌感染主要因食用被細菌污染的食物所致，簡稱爲食物中毒，常見細菌包括大腸埃希菌、沙門菌屬、彎曲菌屬等。
3.寄生蟲感染因接觸感染寄生蟲的生物，或長期食用生食所致，如血吸蟲、隱孢子蟲、籃氏賈第鞭毛蟲等。
長期食用粗糙、刺激性、高鹽、高糖分食物，或進食非甾體類消炎藥物，可刺激胃腸道，誘發炎症。
3.腸道菌羣失調因各種因素導致腸道潛在有害細菌產生毒素，破壞腸道黏膜，導致腸道菌羣、免疫紊亂，誘發炎症。
