由於許多晚期非小細胞肺癌患者採用的化療方案都是經驗處方未經選擇的， 所以相當一部分非小細胞肺癌患者的化療療效不令人滿意，效果不好。兩藥含鉑的一線化療方案化療幾個週期後，肺部病變非但沒有縮小，反而增大了.我們臨牀稱之爲“病變進展”了，醫學專業名詞稱之爲"PD"。
一線藥物化療失敗後的治療我們稱之爲“二線治療”。
二線治療包括二線化療和二線靶向治療。二線化療藥物包括了泰索帝(多西紫杉醇)和力比泰(培美曲塞)， 二線靶向藥物包括了易瑞沙和特羅凱，這幾年會還有更多的化療和靶向新藥物新方案應用於臨牀。
爲了避免非小細胞肺癌一線化療的盲目性，許多有胸外科醫生參與的肺癌中心是通過手術切除、或CT引導下穿刺肺活檢(TTNA)、或超聲纖維支氣管鏡病竈活檢(EBUS-TBNA)、或體表淋巴結活檢術、或電視縱隔鏡淋巴結活檢、或通過電視胸腔經鏡活檢獲取腫瘤組織，通過病理科獲得了準確的肺癌病理診斷，明確了肺癌的病理類型。
再通過檢測肺癌相關基因，明確該肺癌患者對於哪幾個化療藥物會有效，最後確定肺癌化療藥物或靶向藥物組合的治療方案。目前提倡的非小細胞肺癌在基因檢測指導下的個體化化療或靶向治療的治療模式，在明顯提高藥物治療效果的同時，也最大限度地減少了政府和社會廣爲關注的“過度治療”。
不論是一線治療或二線治療，我們都希望各地肺癌中心的胸外科醫生同腫瘤內科醫生一起討論，根據肺癌患者年齡、一般狀況評分、主要臟器功能情況、肺癌病理類型和基因檢測結果，制定化療或靶向治療方案。當然還要考慮患者的經濟狀況。
