嬰兒細菌感染一般不會自愈，必須進行抗感染治療後才能恢復，通常在7-10天左右會恢復健康。治癒時間長短取決於感染的細菌種類、感染細菌的程度以及嬰兒自身的抵抗力有關。
對於抵抗力強、感染細菌不是太嚴重的嬰兒，及時進行抗感染治療後，一般會較快恢復，三到五天基本上就可以恢復了。對於抵抗力差、感染嚴重，則需要大約七到十天的時間可以恢復正常。有些嬰兒可能伴有咳嗽、咳痰，持續的時間會更長。
一旦出現嬰兒細菌感染，首先進行血液培養明確病因，然後選用敏感的抗生素進行抗感染治療，通常選用青黴素類、頭孢類等抗生素。注意給嬰兒適當補充營養，多喝溫開水，避免着涼。經過積極的治療後病情會逐漸好轉。
