西藥治療、碘-131治療和手術治療是甲亢治療的三大常用方法，每一種方法都具有其優點和缺點，選擇治療方式前應充分考慮。
1、西藥治療
優點：藥物作用具有可逆性而極少發生永久性甲低，是青少年尤其是兒童患者的首選治療方法。
缺點：西藥服用時間較長，一般至少1至2年，且具有毒副作用，長期服用對身體會造成損害。對於腫大的甲狀腺組織西藥治療效果較差，且治療後複發率高。
2、碘-131治療
優點：碘-131一次服藥治癒率高，能較短時間內（3個月內）控制甲亢症狀並消除腫大的甲狀腺組織，且藥物本身無肝腎損害、白細胞降低及過敏現象，有效率高達90%以上，被喻爲“不開刀的手術治療”。
缺點：碘-131治療後甲低發生率相對較高，國外發生率>20%，國內發生率大概在6～17%。
3、手術治療
優點：手術治療具有治癒率高、複發率低的特點，短期內即可控制甲亢症狀並能消除腫大的甲狀腺組織。
缺點：手術治療屬於有創治療，具有一定風險， 且容易造成喉返與喉上神經損傷、甲狀旁腺損傷及甲低。
