肺部真菌感染較爲嚴重，不僅影響生活質量，影響肺部功能，嚴重時合併其它併發症。
1、影響生活質量
肺部真菌感染會出現反覆性咳嗽、咳痰、氣喘。急性發作期咳嗽時輕時重，合併其他感染咳出膿性痰。長期咳嗽、咳痰、氣喘影響睡眠質量，導致睡眠質量下降，甚至影響正常工作。
2、影響肺部功能
肺部真菌感染爲深度肺部感染性疾病，長久不愈會影響呼吸系統，累及心肺影響肺部功能，導致呼吸不順暢或呼吸困難。
3、合併其他併發症
肺部真菌感染具有反覆性、持續性特點。反覆性發作誘發心肺疾病；緩慢性發作可發展爲慢阻肺、肺心病、肺氣腫等併發症。
