一般情況下，自閉症的檢查項目有測量身高、體重、頭圍的檢查、全身各部位的體格檢查、全身各系統功能的檢查。具體分析如下：
1.測量身高、體重、頭圍的檢查：瞭解全身體格發育的情況，對照正常兒童的平均值，在平均值上下兩個標準差之間爲正常，超過的爲異常，有一部分自閉症的患兒身高和體重明顯低於同齡兒，也就是說，長得比一般兒童瘦小。
2.全身各部位的體格檢查：全身各部位的體格檢查以瞭解各種器官的發育是否健全，因爲自閉症常與某些先天畸形並存，如結節性硬化，這種孩子臉上常有紅色的皮脂腺瘤，同時還有癲癇，智力低下；苯丙酮尿症，這種孩子的特點是皮膚很白，頭髮從出生的黑色逐漸轉爲黃色，此外還可能與脆性X、嘌呤病等並存，所以醫生不論是先發現自閉症還是先發現先天畸形，都要對孩子進行全面的觀察檢查，以免漏診，延誤治療。
3.全身各系統功能的檢查：對自閉症兒童主要是針對神經系統，首先是12對顱神經的檢查，看看眼球活動是否自如對稱，哭笑時兩側面部鼻脣溝是否對稱，伸舌是否居中自如，視力聽力是否正常，然後再看看四肢活動是否正常，肌力、肌張力的情況，正常的生理反射是否存在，有無病理反射；還要看看痛覺、觸覺、溫度覺等感覺是否正常。
