兒童糖尿病的治療，首選藥物控制病情，再結合飲食和運動調理。Ⅰ型糖尿病只有終身選擇胰島素，而Ⅱ型糖尿病則可選擇胰島素或口服降糖藥。《中國糖尿病防治指南》指出，對兒童和青少年Ⅱ型糖尿病口服降糖藥的選擇及應用基本同成人一樣，但絕大多數的口服降糖藥物卻未在兒童和青少年中做全面系統的安全性研究，因此，許多口服降糖藥物說明書中都不推薦或禁用於兒童和青少年。
口服藥首選二甲雙胍：用於治療兒童青少年2型糖尿病的藥物非常有限，二甲雙胍是第一個獲得美國國家食品藥品監督管理局（FDA）批准用於治療兒童青少年2型糖尿病的口服降糖藥。二甲雙胍臨牀使用多年，是對兒童青少年2型糖尿病安全有效的降糖藥，它的安全性和有效性得到了全世界醫療領域和患者的公認，是治療2型兒童青少年糖尿病首選的口服降糖藥物，尤其在治療肥胖型糖尿病患者中療效顯着。
二甲雙胍在兒童青少年2型糖尿病中是按劑量計算使用的，這和通常兒童用藥按體重計算用量有所不同。兒童青少年2型患者使用的合適劑量是從小劑量開始，根據病人的個體情況，逐漸增加劑量。開始的劑量是每次250毫克，每日2次服用，持續一週，觀察病情，若沒有好轉，可加大劑量，至500-850毫克/次；對於體重50kg以上的兒童患者，剛開始的劑量也可使用成人推薦劑量500毫克/次，每日2次。兒童青少年2型糖尿病患者若伴有高血糖（血糖值＞13.9mmol/l）或有酮症，應考慮胰島素治療，待血糖穩定後，再換用口服降糖藥。
胰島素：胰島素是治療1型兒童青少年糖尿病的首選藥物，特別是在急性糖代謝失調，長期高血糖產生高糖毒性，導致周圍組織胰島素抵抗或患兒糖尿病分型有困難時，宜選用胰島素，以達到比較理想的治療效果。
磺脲類藥物：這類藥物並非治療兒童糖尿病的首選。磺脲類藥物最嚴重的副作用是會產生低血糖，由於兒童處於生長髮育期，低血糖對大腦發育有顯着的影響，目前建議空腹血糖控制在4-6mmol/L，糖化血紅蛋白的水平控制在6.5%-7.0%，對於5歲以下的兒童，這個標準可適當放寬，以防低血糖的發生。
糖苷酶抑制劑：這類藥物對糖尿病能起到一定預防作用，而且服用後此類藥物不會對兒童腸胃道造成明顯不良反應。但這類藥物使用較少，但研究顯示此類藥物安全性較好，可以放心使用。
