一、糞便檢測
1、活滋養體檢測法:常用生理鹽水直接塗層法檢測活動的滋養體，典型的阿米巴痢疾糞便爲醬紅色粘液樣，有特殊的腥味，對急性痢疾患者的膿血便和阿米巴患者的稀便進行鏡檢，粘液中含有集體紅細胞和較少的白細胞，有時可以看到活動的滋養體，這些特徵與細菌性痢疾的糞便不同，採集標本時，容器清潔，糞便樣新鮮
2、包裝檢查法:臨牀上常用碘液塗裝法，該法簡單易行，取乾淨的載體玻璃，滴入碘液1滴，用竹籤取少量糞樣，用碘液塗抹薄片蓋住玻璃，放入顯微鏡下檢查，鑑別細胞核的特徵和數量。
二、阿米巴培養
已有多種改良的人工培養基，常用的如洛克氏液，雞蛋清，血清培養基，營養瓊脂血清鹽水培養基，瓊脂蛋白腖雙相培養基等，但技術操作複雜，需一定設備，且阿米巴人工培養在多數亞急性或慢性病例陽性率不高，一般不宜作爲阿米巴診斷的常規檢查。
三、免疫診斷
近年來，國內外陸續報告了多種血清學診斷方法，其中間接血凝(IHA)、間接熒光抗體(IFAT)和酶聯免疫吸附試驗(ELISA)研究較多，但敏感性不同於各種病例，IHA的敏感性高，對腸阿米巴病的陽性率達到98%，腸外阿米巴病的陽性率達到95%，無症狀的帶蟲者只有10%~40%，IFAT的敏感度比IHA稍差，EALSA的敏感性強，特異性高，有發展前途，腸外阿米巴病的陽性
四、血液檢測
末梢血白細胞總數和分類多爲正常，如有暴髮型或繼發性細菌感染，白細胞總數和中性粒細胞比例可提高，慢性患者可有輕度貧血。
五、結腸鏡檢查
多數病例可見大小不等的散在潰瘍，其中心有滲出，邊緣整齊，周圍有時可見1圈紅暈，潰瘍之間黏膜正常，潰瘍邊緣部分塗片及活檢可見滋養體，通過乙狀結腸鏡或電子結腸鏡直接觀察黏膜潰瘍，並作組織活檢或刮拭物塗片，檢出率最高，據報道直腸，乙狀結腸有病變的病例約佔有症狀患者的2/3，因此，凡情況允許的可疑患者都應爭取作結腸鏡檢，刮拭物塗片或取活組織檢查，滋養體的取材必須在潰瘍的邊緣，鉗取後以局部稍見出血爲宜，膿腔穿刺液檢查應取材於膿腔壁部，才較易發現滋養體。
六、鋇劑灌腸造影
可見充盈缺損及腸腔較窄，腸壁的阿米巴膿腫及肉芽腫突入腸腔，形成鋸齒狀陰影。
