慢性結腸炎經常引起很多疾病。具體來說，
1、中毒性結腸擴張
急性活動期間發生，發生率約爲2%，炎症影響結腸肌層和肌肉間神經叢，腸壁張力低，節段性麻痹，腸內容物和氣體大量積累，急性結腸擴張，腸壁薄，病變多見乙型結腸或橫結腸。誘因有低血鉀、鋇劑灌腸、抗膽鹼能藥物和鴉片類藥物等。臨牀表現爲病情快速惡化，中毒症狀明顯，伴有腹脹、壓痛、反跳痛，腸鳴聲減弱或消失，白細胞增多，x線腹平片可見腸腔變寬、結腸袋消失等。容易併發腸穿孔。病死率可達11%~50%。
2、潰瘍穿孔
結腸擴張容易引起潰瘍穿孔和急性瀰漫性腹膜炎。
3、潰瘍出血
除了潰瘍引起血管出血外，低凝血酶原血癥也是重要原因。往往因爲出血量大而需要治療。
4、癌變
癌變的發生與病期和病變範圍有關，病程越長，範圍越廣，癌變越多。發生率約爲5%，比沒有結腸炎的人高10倍，結腸炎的病變多見於全結腸、幼年發病和病史超過10年的人。
5、結腸狹窄和腸梗阻
修復過程中，大量纖維組織形成的疤痕可引起結腸狹窄和腸梗阻，多見於結腸遠端。
