扁桃體結石使患者的口腔產生不適、口臭，嚴重者還會出現吞嚥困難，口涎增多，非常影響患者的正常生活，對於扁桃體患者來說也是非常痛苦的，所以要積極進行治療。那麼，怎麼治療扁桃體結石比較好呢?
小結石可用刮匙或鉗子挖出，大結石須在表面麻醉下切開粘膜取出，但須防止墜入呼吸道。若因結石刺激引起周圍炎症可以局部治療，大多數牙醫和醫生建議，使用水接水及鹹水含漱液消除扁桃體結石，而不是其他， 使用異物可造成疤痕和不適。
強大的漱口水經過認證，用於消除口臭，不僅防止口臭，更能有助於消除滋味以及減少細菌造成口臭。許多人患有扁桃體結石，可以看到一白色的薄膜覆蓋了他們的舌頭。 這是因爲太多的細菌和粘液。 使用刮板以輕柔刮舌頭不但清潔本身，更是減少口臭方法之一。
扁桃體結石只會增長扁桃腺，所以這些人的長期存在的問題可能受扁桃體影響。 切除這種手術，當然是最後的手段，許多醫生甚至不會做，除非還有其他嚴重的症狀和相關問題的經常性喉嚨痛。雖然本身無害，扁桃體結石是一種刺激，臭的問題，讓人難以忍受他們。
它們構成了裂縫的扁桃腺，而且往往很難看到，而不是那麼容易消除。 良好的衛生，沖洗漱口，水及鹹水含漱液能幫助消除扁桃體石塊，並減少口臭。因此在平時生活中一定要特別的注意，應該儘可能的注意口腔以及牙齒的衛生。比如養成早晚刷牙的習慣，這是最基本的衛生習慣，以免細菌的滋生。
