乙型病毒性肝炎，簡稱乙肝，是一種由乙型肝炎病毒（HBV）感染機體後所引起的疾病，其發病機制非常複雜，肝細胞病變主要取決於機體的免疫狀況，免疫應答既可清除病毒，同時亦可導致肝細胞損傷，甚至迫使病毒變異。
目前，HBV侵入肝細胞的機制尚未完全明瞭，研究認爲HBV進入肝細胞後即開始其複製過程，HBVDNA進入細胞核形成共價閉合環狀DNA（cccDNA），以cccDNA爲模板合成前基因組mRNA，前基因組mRNA進入胞漿作爲模板合成負鏈DNA，再以負鏈DNA爲模板合成正鏈DNA，兩者形成完整的HBVDNA。
肝細胞內HBV數量與細胞病變並無明顯相關性，HBV並不直接導致肝細胞病變，即使可直接損傷亦非重要。肝細胞病變主要有細胞免疫反應所致，機體免疫反應不同，導致臨牀表現各異，當機體處於免疫耐受狀態，不發生免疫應答，多成爲無症狀攜帶者；當機體免疫功能正常時，多表現爲急性肝炎經過；當機體免疫功能低下、不完全免疫耐受、自身免疫反應產生等情況時，可導致慢性肝炎等。
