軟骨瘤根據生長部位不同採取不同的手術方案，能夠治好，但是容易復發。
1、手掌、足部短狀軟骨瘤
手掌、足部短狀軟骨瘤，應將局部病變組織完全刮除，去除局部腫瘤組織後進行植骨手術即可。長管狀骨的軟骨瘤利用刮除術，術後容易反覆發作，可選擇腫瘤段切除術、大塊骨移植術，術後併發症較少，恢復較快。
2、多發性軟骨瘤
多發性軟骨瘤損害明顯高於單發性，不僅生長部位易發生骨折，而且有惡變傾向。也應嚴格按照治療惡性骨腫瘤方法進行治療，手術去除軟骨瘤後，對其部位進行放療或者是化療，以免病情進一步惡變，誘發其他部位出現轉移性症狀，防止病情反覆發作。
