針對急性期精囊炎的治療方式主要指抗生素治療，但抗生素的選擇往往需要根據細菌培養，或者是其他方式確定使用。而慢性精囊炎在無特殊情況下，以抗生素，以及一些輔助治療方式綜合治療，而針對特殊情況的患者，或採取手術治療方式，下面，就精囊炎的治療方式進行介紹：
1.手術治療
如果囊腫是開放的或術前抽吸過，液體將呈現稀薄、白色或混濁狀，在顯微鏡下檢查進可見不活動的精子。精囊炎手術切除帶來的併發症很輕微，也很少見，包括陰囊血腫，不育症。如果睾丸的血液供應受到影響，可以出現睾丸萎縮。不需要生育的中老年患者，可以接受小劑量X射線局部照射，既能促進囊腫萎縮，也無明顯副作用。
2.局部治療
局部治療採用黃連素離子透入，大便後用1‰黃連素20毫升灌腸，用藥浸溼紗布墊置於會陰部，並連接在直流電理療器的陽極上，陰極敷於恥骨上，每次20分鐘，每日一次，每10次一個療程。溫水坐浴及會陰部熱敷，以改善局部血運，助炎症消退。
3.使用抗生素
急性精囊炎應治療到症狀完全消失後，再繼續用藥1～2周;慢性精囊炎則需繼續用藥4周以上，以鞏固療效。細菌引起的精囊炎，可用抗生素把引起精囊炎的細菌徹底清除乾淨，只有經過化驗發現細菌確實全部消失，纔可以停藥;如果病情比較嚴重，如出現尿道堵塞時，需住院治療;發生血精者可用乙烯雌酚1毫克加強地鬆5毫克口服，每日3次，連服2～3周，多能使血精停止。
總體來說，精囊炎的治療方式主要是抗菌消炎，一般在藥物使用得當的情況下，症狀表現方面在一週左右可以得到緩解，但如果說到治癒精囊炎，或者說完全殺死致病菌，就必須堅持治療，同時注意用藥的規範性，因爲藥物治療也存在一定的缺陷。
