複方小兒退熱栓多數患兒用藥後可在半個小時到一個小時內見效，具體時間應結合對藥物的敏感性以及病情嚴重程度來分析。
複方小兒退熱栓的成分主要是布洛芬或對乙酰氨基酚，屬於解熱鎮痛類藥物，效果較爲明顯，大多數患兒用藥一到兩小時後藥物濃度可以達到峯值，一般在服藥後半個小時到一個小時左右開始起效，兩個小時左右體溫會明顯下降。不過由於對藥物的敏感性以及病情嚴重程度不同，應用複方小兒退熱栓見效的時間存在較大的個體差異。
如果病情較輕，並沒有出現反覆高熱的現象，且患兒對複方小兒退熱栓的敏感性比較高，用藥後通常能夠在半個小時左右見效。若病情較爲嚴重，體溫在39度以上，發生反覆高熱，或患兒對複方小兒退熱栓的敏感性比較弱，用藥後可能需要一個小時以上才能見效，甚至不能見效。小兒發熱以口服退熱藥爲首選，不能進行口服再考慮栓劑。
