慢性扁桃體炎反覆發生，可誘發風溼性心臟病、關節炎、慢性腎炎等疾病，炎症蔓延至周圍鄰近器官，可引起中耳炎、鼻竇炎、支氣管炎，嚴重時可引起左心衰竭，可因扁桃體周圍膿腫破裂導致死亡。
一、誘發其他疾病
慢性扁桃體炎可引起咽部乾燥、堵塞感，出現粘稠分泌物且不易咳出。反覆發作可誘發風溼性心臟病、關節炎、慢性腎炎等其他疾病。
二、蔓延至鄰近器官
慢性扁桃體炎可蔓延至周圍鄰近器官，引起鼻竇炎、中耳炎、支氣管炎等。兒童慢性扁桃體炎可引起慢性上呼吸道梗阻，影響兒童生長髮育，嚴重時引起左心衰竭。
三、導致扁桃體周圍膿腫
慢性扁桃體炎急性發作反覆發生，嚴重影響日常工作和學習，可導致扁桃體周圍膿腫。膿腫破裂嚴重，可影響呼吸，感染擴散至胸部、頸部，可導致死亡。
