生母可以選擇不參與鑑定。親子鑑定中，孩子及假設父親的標本通常足以得知結果，母親可以選擇不參與鑑定。親生母親也檢測，結論更準確。因爲孩子的基因一個來自母親一個來自父親。若有生母做參考（即雙親鑑定），可以根據母親和孩子的基因型，比較明確推導出生父的基因，從而與爭議父（即您）作比較。若沒有母親，則直接根據孩子基因推導生父基因，這樣可能的情況有很多，最終統計學得出的數值偏差相對大點。
實際上，我們普遍使用的檢測15個STR基因座的結果進行過計算機模擬單親案例，兩個無血緣關係的人，用這一的檢測系統，至少有3個違反遺傳法則，99.99%的非父親可以排除，但有1/1000的可能無法排除而錯誤認定。因此我們對於單親鑑定，跟其他機構不同之處是另外還增加一個試劑盒，增加9個檢測指標，這樣更準確，儘可能避免出現偏差。這也是單親鑑定收費要高於生母參與鑑定的原因。
