便常規檢驗的目的是瞭解消化道有無細菌感染以及寄生蟲感染，能及早發現胃腸炎、肝病等常見疾病，甚至能早期揪出大腸癌等腸道癌症的苗頭。
1、便常規檢查可在糞便中查到的寄生蟲蟲。
2、便常規檢查檢查消化道出血是一項非常有用的診斷指標。消化性潰瘍、藥物致胃粘膜損傷、腸結核、克羅恩病、潰瘍性結腸炎、結腸息肉、鉤蟲病以及胃癌、結腸癌等消化道腫瘤時，糞便隱血試驗均常爲陽性。糞便檢查可作爲消化道腫瘤篩選的首選指標。尤其對中老年人早期發現消化道惡性腫瘤有重要價值。此外在流行性出血熱患者的糞便中隱血試驗也有84%的陽性率，可作爲該病的重要佐證。
3、便常規檢查中的白細胞檢查可以發現炎症，在正常糞便中不見或偶見白細胞，多在帶粘液的標本中見到，主要是中性分葉核粒細胞。小腸炎症時包細胞數量不多，均勻混於糞便內，且因細胞部分被消化而不易辨認。結腸炎症時，可見大量白細胞或成堆出現的膿細胞，亦可見到吞有異物的小吞噬細胞。
