蘑菇的根是最難清洗的地方。短根有很多沉澱物。如果不切割和清洗，很容易損壞菌蓋。切斷根並單獨清洗。蘑菇的菌蓋會分泌粘液，吸收大量沉澱物，不易清洗。輕輕向同一方向旋轉菌蓋。沉澱物會隨着菌蓋褶皺部分的沉澱物而掉落。重複幾次後，沉澱物會掉落乾淨。
清洗蘑菇時，將適量的鹽放入水中攪拌溶解，將蘑菇浸泡在鹽水中一段時間，沙子會沉入盆底，然後用清水沖洗蘑菇表面的沉澱物，易於清洗。
將蘑菇浸泡在加入糖的水中約10分鐘。當糖水完全溶解後，用手輕輕擦洗蘑菇，用筷子旋轉蘑菇幾圈，用乾淨的水沖洗，沖走蘑菇表面的沉澱物。
洗米湯後，不要倒掉。將蘑菇浸泡一會兒，然後朝一個方向攪拌蘑菇。沉澱物掉落後，用水清洗，沉澱物可以清洗乾淨。
避免過度用水清洗蘑菇，吃前過度用水浸泡蘑菇會導致營養流失。
香菇用糖水洗的雖然能省去很多麻煩，但是會加速水溶性成分如多糖，優質氨基酸等大量溶解在水中，降低香菇的營養價值。所以，能不用糖水洗就不用吧。
清洗蘑菇時，不要用手抓住蘑菇，這會破壞蘑菇的纖維物質，也不能向相反的方向攪拌蘑菇，這樣沙子就不會掉下來，而是入蘑菇蓋的褶皺，使其更難清洗。
