脂肪肝的病因學包括脂肪肝發生的條件（誘因）和導致脂肪肝的原因（致病因素）兩個方面，在脂肪肝的發生發展過程中，機體的免疫狀態，營養因素，遺傳因素，生活方式以及年齡和性別等均起相當重要的作用，即爲脂肪肝發病的條件因素。
脂肪肝的致病因素有化學因素，營養因素，內分泌代謝因素，生物性致病因素，遺傳因素等。
環境
研究表明。飲食、營養狀態、食物污染以及肝炎病毒的感染等因素與脂肪肝的發生密切相關。
化學
包括化學毒物（黃磷，砷，鉛，苯，四氯化碳，氯仿等），藥物（甲氨蝶呤，四環素，胺碘酮，糖皮質激素等），酒精等，嗜酒一直是歐美脂肪肝和肝硬化最常見的原因。
飲食
食量過多，體重超重造成的肥胖是近年來引起脂肪肝最常見的因素之一，蛋白質及熱量缺乏是脂肪肝的另一重要原因。營養不良是一種慢性營養缺乏病，主要是由於人體長期缺乏能量和蛋白質所致，根據原因不同，可分爲原發性和繼發性兩大類。
（1）原發性營養不良：主要因食物蛋白質和能量供給或攝入不足，長期不能滿足人體生理需要所致，多發生在發展中國家或經濟落後地區。
（2）繼發性營養不良：多由其他疾病所誘發，歐美等發達國家以及年長兒童和成年人中發生的營養不良以繼發性爲多，常見於吸收不良綜合徵，慢性感染與炎症性疾病和惡性腫瘤等慢性消耗性疾病，食物中缺乏蛋白質，即使熱量足夠也可引起脂肪肝，營養不良引起的脂肪肝主要見於兒童許多內分泌代謝性疾病如皮質醇增多症，甲狀腺功能亢進，高尿酸血癥，高脂蛋白血癥和糖尿病高脂血症等均可引起肝細胞脂肪變性，其中以非胰島素依賴性糖尿病與脂肪肝的關係最爲密切。
生物
包括病毒和細菌等病原微生物及寄生蟲，這些致病因素主要引起肝細胞變性壞死及炎性細胞浸潤，近來研究發現部分丙型肝炎病毒，丁型肝炎病毒感染可分別引起大泡性和小泡性肝細胞脂肪變性，肺結核，敗血症等一些慢性細菌感染性疾病，也可因營養不良，缺氧以及細胞毒素損害等因素導致肝細胞脂肪變性，此外各型病毒性肝炎恢復期以及慢性病毒感染均可誘發肥胖性脂肪肝。
遺傳
主要是通過遺傳物質基因的突變或染色體的畸變直接致病的，在肝臟，它們主要引起先天性代謝性肝病，其中肝豆狀核變性，半乳糖血症，糖原累積病，果糖耐受不良等遺傳性疾病可引起大泡性脂肪肝，而尿素循環酶先天性缺陷，線粒體脂肪酸氧化遺傳缺陷等則可引起小泡性脂肪肝，此外某些家庭中的人具有某種疾病的素質，如肥胖，Ⅰ型糖尿病，原發性高脂血症等，此種現象稱其爲遺傳易感性。
