核酸檢測時交叉感染可能性較小，核酸檢測目前採用的是咽拭子採集標本。要求採集人員對被被採樣的人員進行單室單間採集，採集時所用的咽拭子均爲一次性物品，每次操作者在進行採集前後均需要進行手消毒，更換一次性用品。
核酸檢測陰性結果有效期定在7天之內。理想的核酸檢測陰性結果有效期，設定的越短就越安全。但太短，則需要頻繁檢測，現實中難以操作。那麼，核酸檢測會不會交叉感染？
核酸檢測時交叉感染的機率很小，因爲做核酸檢測的所有用具、用品，比如採樣的裝備瓶、採樣者的口罩、拭子及其他採取的相關運用器等，基本都是一次性的，都會一採一換的方式。並且醫務人員在進行檢測時，會做到採樣一次，消殺一次，以確保不會發生交叉感染。如果是在戶外人數較多的情況下，需要保持安全距離，通風，這種情況下，採集標本被感染的可能性也大大降低。
若普通民衆沒有流行學病史的人羣，一般做一次核酸檢測即可，對於去過、途徑中高風險地區的，或者與確診、高度疑似感染人羣接觸過時，通常需要進行兩次或兩次以上的檢測，對於感染患者治療痊癒後，同樣也需要進行兩次或者兩次以上的檢測陰性才能出院，所以核酸檢測做幾次，要根據不同人羣來看。
