一般情況下，規範服用連翹可以保護肝臟，並不對肝臟有損害。但長期大量服用連翹，有可能損傷肝臟。具體分析如下：
連翹性涼、味苦，入心、肝、膽經，有清熱解毒、抗菌消炎、保護肝臟的功效。嚴格遵醫囑規範服用連翹，可在肝臟表面形成保護膜，阻止病毒對肝臟的損害。還可以促使受損肝細胞儘快修復，並促使體內肝原的產生，提高肝臟的解毒能力，預防肝臟病變，對肝炎、肝硬化等肝臟疾病有輔助治療的作用。
但連翹作爲一味中藥，也有一些副作用。因藥物需在肝臟內代謝，如長期大量服用連翹，偶爾會出現肝毒性症狀，導致一過性血清氨基轉移酶升高。
