食管癌的發病有明顯的家族聚集現象。在食管癌高發區，連續3代或3代以上出現食管癌患者的家族屢見不鮮。在我國山西、山東、河南等省的調查發現，有陽性家族史的食管癌患者佔1/4～1/2，高發區內陽性家族史的比例以父系最高，母系次之，旁系最低。由高發區移居至低發區的移民，即使在百餘年以後，其發病率也相對較高。此外，居住環境也影響到食管癌的發病，現已發現，高發區內與家族共同生活20年以上的食管癌患者佔l/2。遺傳和環境因素對食管癌發病的影響可能是分子水平上的變化。研究發現，在某些癌症高發家族中，常有抑癌基因，如p53的點突變。在這類人羣中，如有後天因素引起另一條等位基因的突變，則會造成癌基因的異常表達而形成癌腫。近年來的資料顯示，食管癌患者中確實存在癌基因和抑癌基因的突變。
