阻生牙的危害有很多，由於容易堆積食物殘渣，首先容易造成齲齒，同時可能會引發冠周炎，誘發三叉神經痛等。
一、齲齒
阻生牙容易導致食物殘渣堆積，再加上口腔不易清潔，很容易形成齲齒，影響到周圍的牙體組織，也會損害口腔健康，併發多種口腔問題。
二、冠周炎
阻生牙萌出過程中，牙冠可部分或全部爲齦瓣覆蓋，齦瓣與牙冠之間形成較深的盲袋，這成爲窩藏食物殘渣、滲出物及細菌的天然場所。冠部牙齦因咀嚼食物而損傷，形成潰瘍，當抵抗力下降時，就容易引起冠周炎的急性發作。
三、三叉神經痛
阻生牙嚴重時還會誘發三叉神經痛，智齒阻生牙的發生會成爲三叉神經痛的病竈，所以必須要及時接受治療，否則可能導致面部腫脹，張口困難。
