肛周膿腫手術的方法應視膿腫深淺而定，橫隔痙膜以下的手術可直接切開，做一次根治。但深部膿腫則要切開做引流比較合適，二期再做根治，因爲一次根治術，可能會影響肛門的功能，應先做一期切開引流，等引起肛瘻以後，再做肛瘻根治術。
肛周膿腫是肛管直腸周圍間隙發生的急慢性感染，而形成的膿腫由於發生的位置不同，有不同的名稱，治療方法也不一樣，術後併發症也不同。患者對於肛周膿腫手術治療方法都十分關心，畢竟手術的方法關係着疾病的康復機率以及治療費用和手術痛苦程度。
常見的肛周膿腫外科手術方法有以下幾種：最常見的肛周膿腫的一次性切開法，適用於淺部的膿腫。皮下的膿腫一次性切開掛線法適用於高位膿腫，如由肛隱窩感染，而致坐骨直腸間隙、骨盆直腸間隙、後間隙、直腸後間隙膿腫以及馬蹄形的肛周膿腫等。一次性切開掛線法，我們常配合開窗的留橋和虛實掛線等。
分次手術的適應症，適用於體質虛弱或不願住院治療的深部膿腫，等待形成肛瘻之後，再按肛瘻的處理。常見的併發症：肛周膿腫的局部症狀是紅、腫、熱、痛，患者因疼痛，局部的充血、水腫、坐立不安，常拒絕的排便，但長期如此，可引發繼發性的便祕，腸道中宿便水分不斷地蒸發，使大便堅硬難以排出，最後形成糞坎塞。
肛周膿腫若不及時治療，除了自行潰破形成肛瘻外，可能形成敗血症、菌血症、毒血癥等。症狀爲高熱、寒戰、胃寒，甚至發生中毒性的休克、昏厥、血壓下降，危及生命。肛周膿腫不同的處理方案，有不同的併發症，如肛周膿腫選擇保守治療。
肛周膿腫，最需要進行的手術是切開引流促進膿液排出，促進傷口癒合，一定要注意，飲食清淡，注意加強換藥，積極的應用消炎藥治療，促進早日康復。肛周膿腫如果是炎症期的話，還沒有形成膿液現在可以用抗生素消炎抗感染治療，如果逐漸腫塊增大並加重，形成膿液，就必須要手術治療，這個沒有什麼特別的方法，就是切開引流或者做根治手術，一般切開引流手術肯定還要做二次根治，所以如果可以的話可以做一次性根治手術。建議去正規醫院肛腸科手術。
