兒童心肌損害能不能除根，要根據病情輕重及發病原因進行分析。病毒感染引起的一過性損傷、手術導致的損傷通常都能除根，暴發性心肌炎引起的心肌損傷不能除根。
部分兒童因患有病毒性感冒而造成一過性心肌損傷，這種屬於輕度心肌損傷，並未引起明顯的臨牀症狀，堅持應用維生素C顆粒、果糖二磷酸鈉片、輔酶Q10片等營養心肌的藥物治療，並多注意休息，多數情況下可以治癒，而且不會留下後遺症。
部分兒童心肌損害是手術所致，如心臟導管手術或心臟外科手術，這種情況也能根治。不過有一部分患兒的心肌損害雖然得到根治，可卻會在心肌留下疤痕，容易引發心律失常。
如兒童患有暴發性心肌炎，導致心肌損傷，這種情況非常兇險，容易危及生命，多數情況下不能除根。雖然經過治療之後可以度過急性期，但多數人都會留下後遺症，如縮窄性心包炎、心衰等。
