眼尾疼多是受倒睫、瞼腺炎、結膜炎等因素導致，治療方法需根據病因進行治療，具體如下：
眼尾上下眼瞼處出現眼睫毛倒向角膜表面生長，會與角膜上皮發生摩擦，引發眨眼時疼痛，需針對倒睫進行治療，包括物理拔除、消融、手術等。
瞼腺炎也被稱爲麥粒腫，主要是受到金黃色葡萄球菌感染，而引起的化膿性改變。眼瞼會局部充血、脹痛、眨眼疼痛等。需局部使用抗生素滴眼液，如左氧氟沙星等。
如病原微生物感染或是過敏引發結膜炎，會出現眨眼時疼痛、結膜充血、眼睛畏光等症狀。治療方法以抗菌藥物或抗病毒滴眼劑爲主，平時要注意用眼衛生。
