艾草蚊香棒對身體是有一定的害處，艾草本身成分溫和對人體無害，但因爲蚊香棒含有菊酯，超過一定劑量是有害的。
艾草是一種能散寒除溼、行氣活血、溫經通絡、消腫止痛的中藥，也是一種天然的驅蚊材料，經常在驅蚊產品中用作原料。通過點燃蚊香棒或是用艾草水洗澡，都有驅蚊的效果。蚊香棒是一種利用高溫燃燒作用，將殺蟲成分釋放在空氣當中，起到殺蟲作用。
但是蚊香棒本身主要成分是有機磷、氨基甲酸酯、菊酯類等等其他化合添加劑組成的，而且蚊香燃燒會釋放出很多對人體有害的物質，如甲苯等化學物質，可能會刺激人的呼吸道引發哮喘等呼吸疾病。
孕婦和嬰兒、孩童要慎用艾草蚊香棒，驅蚊可以考慮選擇液體電蚊香，以及蚊帳、花露水、艾草薰燃等其他方式來驅蚊。
