甲狀腺結節可以吃藥包括西藥和中藥。西藥以左甲狀腺素爲主，多用於改善甲狀腺功能正常增生性結節或結節性甲狀腺腫，也可使用硒酵母或抗甲狀腺藥物。中藥多爲中成藥及中藥湯劑，如杞菊地黃丸、夏枯草口服液等，需辨證論治。
如診斷爲甲狀腺功能正常增生性結節或結節性甲狀腺腫，可應用左甲狀腺素治療。該藥能抑制促甲狀腺激素分泌，有效縮小良性甲狀腺結節體積。
該藥富含硒類物質，爲補硒常用藥，可改善因低硒導致甲狀腺結節，減緩甲狀腺結節增長速度。服用時間不宜超過三個月，如三個月仍未好轉，需停止服藥，並及時就醫，調整治療方案。
如甲巰咪唑，適用於甲狀腺結節合併甲亢，該情況可能是高功能腺瘤，口服抗甲狀腺藥物有一定治療作用。但長期使用此藥可對肝臟產生嚴重副作用，用藥期間需定時檢測肝功能。
包括杞菊地黃丸、夏枯草口服液等中成藥及具有活血化瘀、解鬱散結效果中藥湯劑。中藥治療爲普遍性治療，且講究辨證論治，應找專業中醫開專業方劑，針對性較強。如用藥三月結節未變小，需停藥。
