在甲狀腺三種主要的抗體中，抗甲狀腺過氧化物酶抗體和抗甲狀腺球蛋白抗體，這兩種抗體持續存在，是維持自身免疫性炎症，疾病呈慢性特徵的關鍵因素，是自身免疫性甲狀腺炎的重要診斷指標，對於甲狀腺炎、甲狀腺結節、甲狀腺癌、甲狀腺功能亢進症、甲狀腺功能減退症等都有一定的檢測價值。
抗甲狀腺過氧化物酶抗體和抗甲狀腺球蛋白抗體高，代表着患者自身的免疫系統出現了紊亂，導致這兩種抗體被錯誤地生產過多，與甲狀腺細胞產生嚴重的對抗。
抗甲狀腺過氧化物酶抗體(TPOAb)、抗甲狀腺球蛋白抗體(TgAb)陽性是確定原發性甲狀腺功能減退症病因的重要指標。甲狀腺過氧化物酶抗體增高，甲狀腺功能中促進甲狀腺激素增高，甲狀腺激素減少等，考慮到存在自身免疫性甲狀腺功能減退症。甲狀腺功能減退症是由於甲狀腺激素合成和分泌減少而降低身體代謝的內分泌疾病，可根據病因、臨牀表現進行甲狀腺功能檢查等診斷。
抗甲狀腺球蛋白抗體與抗甲狀腺過氧化物酶抗體不同，抗甲狀腺球蛋白抗體上升難以追溯原因，抗甲狀腺球蛋白抗體上升的原因不單一，多數情況下抗甲狀腺球蛋白抗體上升。根據甲狀腺球蛋白抗體的判斷，需要結合甲狀腺功能和超聲波等綜合檢查方式進行判斷。
此外，還有一些非疾病原因，比如自身免疫力下降，或者服用一些藥物，可以出現甲狀腺過氧化物酶抗體和抗甲狀腺球蛋白抗體高的情況，如轉移因子、薄芝糖肽等。因此，在兩種抗體升高的情況下，仍需檢查甲狀腺激素的情況後，綜合判斷，建議定期檢查和綜合治療時，注意飲食，不要吃含碘量高的食物。
