干擾素有許多亞型，主要分爲α、β和γ三大類型。以往的研究發現，干擾素β進入血液中穩定性差、易被滅活，干擾素γ療效不如α和β，因此目前臨牀上用於治療病毒性肝炎的干擾素主要是干擾素α-2b、干擾素α-1b和干擾素α -2a 。
這三種干擾素的效果基本相似，但中國人的白細胞經病毒刺激後誘生的干擾素中最主要的亞型是α-1b，其次是干擾素α-2(包括2b、2a )。因此從理論上講，干擾素α-1b更接近中國人的自然狀況，使用干擾素治療後不良反應較少，且產生干擾素抗體的機率也更小。
干擾素還分爲普通干擾素和長效干擾素(即：聚乙二醇干擾素)。聚乙二醇干擾素是將干擾素α與聚乙二醇分子連接起來，使聚乙二醇分子在干擾素分子外面形成一個分子屏障，降低了干擾素的免疫原性，保護了它進入體內後免受酶的分解，半衰期延長至40～100小時(普通干擾素半衰期僅爲4小時)，因此可以每週1次給藥，故稱之爲長效干擾素。
這種干擾素劑型可保持血液中有較穩定的高濃度干擾素水平，提高了療效(比普通干擾素的療效大約提高10%左右)，同時也減少了病人的注射次數，從而提高了病人的依從性和生活質量。
目前上市的長效干擾素也有兩種劑型：聚乙二醇干擾素α -2a 注射液(派羅欣)和聚乙二醇干擾素α-2b(佩樂能)。兩者比較，佩樂能注射後發熱較派羅欣常見，但由於其血漿半衰期比派羅欣稍短，故對骨髓系統的抑制較派羅欣輕，白細胞下降發生率低於派羅欣。因此，發熱較重者可選用派羅欣，白細胞較低者可選用佩樂能。
另外建議使用干擾素治療的病人小量購買，千萬不要圖便宜大量批發。先購買1周的藥量，可先從300萬單位的劑量用起，如發熱症狀輕，其他不良反應也不明顯，再按月購買或增加劑量。長效干擾素可先購買1支，注射後可以耐受的患者再繼續購買。這樣，一旦需要停藥或更改劑量，也可避免一定的經濟損失。
