阻礙卵子與精子結合或阻礙受精卵着牀的原因。如先天性無子宮、無陰道、子宮發育不良（幼稚型子宮）及子宮畸形，或陰道、處女膜閉鎖等。後天性如各種生殖炎症，包括陰道炎(滴蟲、黴菌、淋病等)和重度宮頸炎，產生大量黃膿樣分泌物，影響陰道酸鹼度不利於精子活動和生存的結核性輸卵管炎可能導致輸卵管腔堵塞。
“原因不明”性不孕。約佔不孕症總數的１０％。得了不孕症進行全面系統檢查，其中包括全身體格檢查，生殖器官狀態及功能檢查。如果生殖器正常，應進行特殊檢查，包括基礎體溫檢查、陰道塗層、宮頸粘液檢查、子宮內膜活檢、輸卵管流暢檢查、結婚測試、各種激素測試等。
影響卵巢產生卵子的原因是先天性卵巢缺陷或發育不全等先天性因素，後天性因素如腫瘤、炎症、手術、放射線破壞或切除卵巢組織，不能產生卵子。
內分泌功能的原因。女性患全身性疾病，精神過度緊張或不安引起的神經內分泌功能障礙、營養不良或維生素不足、急性傳染病、結核病、各種物理因素(鉛、乙醇、菸草等)引起的慢性中毒，可引起不育症。
